发现蛋白质组学（Discovery Proteomics）是蛋白质组学的一个研究方向，专注于通过高通量的技术手段识别和探索未知的、潜在的生物学蛋白质。与目标导向的蛋白质组学不同，发现蛋白质组学并不局限于特定的已知蛋白质或特定的生物学过程，而是力求全面地发现与某一生物体或生理状态相关的所有蛋白质及其潜在功能。这一领域的核心目标是通过实验和数据分析，揭示复杂生物系统中的蛋白质种类、数量、变化及其功能，为生命科学的基础研究、疾病机制的探索以及药物研发提供全新的视角。在发现蛋白组学中，研究者往往关注的是大量的未知蛋白质，这些蛋白质可能在已知的数据库中没有记录或者其功能尚未明确。通过应用质谱技术（Mass Spectrometry, MS）、高效液相色谱（HPLC）等高通量技术，发现蛋白质组学能够从细胞、组织或体液中提取、分离和鉴定上千种不同的蛋白质，并深入分析它们的表达模式、翻译后修饰及其生物学功能。这些信息能够帮助研究人员发现新的生物标志物、揭示新的信号通路，甚至为新的治疗靶点的发现提供线索。不仅能够揭示蛋白质的多样性，还能够为疾病的早期诊断、精准治疗以及新药开发提供关键的生物学数据。例如，在癌症的研究中，发现蛋白质组学能够帮助识别与肿瘤发展相关的新型蛋白质标志物，为癌症的早期筛查提供可能的靶标；而在药物开发领域，它能够提供蛋白质靶点，推动新药的研发和优化。

发现蛋白质组学的基础是实验技术的进步尤其是质谱技术的应用，质谱技术可以高效地识别复杂样本中的蛋白质并提供关于蛋白质质量、氨基酸序列及其翻译后修饰等详细信息。现代发现蛋白质组学常用的技术和方法包括以下几个方面：

1、质谱分析（Mass Spectrometry, MS）

质谱技术是发现蛋白质组学的核心技术之一，它通过精确测量带电分子（如蛋白质及其片段）的质量与电荷比（m/z）来识别和定量样本中的蛋白质。质谱仪可以提供蛋白质的分子质量、序列信息以及翻译后修饰的情况。在实际应用中，液相色谱-质谱联用（LC-MS/MS）技术常常用于蛋白质的分离和分析，这一技术可以将复杂的样本中的成千上万种蛋白质分离开来并进行高效的质谱分析，从而全面扫描样本中的蛋白质成分。

2、蛋白质鉴定与定量

在发现蛋白质组学中，蛋白质的鉴定和定量是至关重要的步骤。研究人员通过对质谱数据进行分析，能够从已知的蛋白质数据库中匹配样本中的蛋白质并定量其在不同条件下的表达变化，常用的鉴定方法包括数据库搜索（如Mascot、Sequest等）和谱图匹配方法。定量技术如标签定量（TMT、iTRAQ等）和非标签定量（如LC-MS/MS峰面积法）则能够帮助研究人员了解不同样本中蛋白质的表达水平，揭示蛋白质的相对丰度变化。

3、翻译后修饰分析

蛋白质在合成后常常经历一系列的翻译后修饰（PTMs），如磷酸化、乙酰化、糖基化等，这些修饰直接影响蛋白质的功能和稳定性。发现蛋白质组学通过质谱技术分析翻译后修饰的类型和模式帮助研究人员揭示蛋白质的功能调控机制，翻译后修饰的研究有助于理解信号传导、基因表达调控以及细胞应答等过程。

4、蛋白质组数据的分析与解读

随着高通量数据的生成，蛋白质组数据的分析变得异常复杂。现代的发现蛋白质组学不仅依赖实验技术的支持更加依赖于先进的计算方法与算法，如统计学方法、机器学习算法和生物信息学工具。这些工具可以帮助研究人员从庞大的数据中提取有意义的信息，进行蛋白质鉴定、功能注释、通路分析及生物标志物发现。

百泰派克生物科技在蛋白质组学领域积累了丰富的经验，致力于为客户提供全方位的蛋白质组学研究服务。我们的服务覆盖从实验设计、样本准备到数据采集、分析和解读的全过程，确保为客户提供高质量、精准的数据支持。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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